כנימות עלה בתחילת העונה אינן מזיק שממהרים לרסס נגדו. גם אם אוכלסיית הכנימות גבוהה אנו נוטים להמתין להופעתם של האויבים הטבעיים, ואלו מנקים, בדרך כלל, את הצמחים. יש מקרים בהם הכנימות תוקפות את הצמחים הקטנים בעצמה רבה, ולא נעלמות במשך זמן רב, ואז מתערבים בריסוס. התכשיר המקובל לריסוס נגד כנימות עלה הוא מוספילן. עדיין לא נקבע בתווית המינון המומלץ, והחקלאים מרססים לפי ראות עיניהם.
בניסוי נבדקו התכשירים נימבצידין, אפלורד בתוספת שמן EOS, וDBI-, להדברת כנימת עש הטבק, בהשוואה לפגסוס ולהיקש. הניסוי בוצע באמצעות מרסס גב מוטורי. הבדיקות כללו ספירה של זחלים על עלה מרבי. בספירות היתה ירידה במספר הזחלים בכל הטיפולים, כולל בביקורת, ולכן לא ניתן ללמוד מניסוי זה על יעילותם של התכשירים שנבדקו.
בשנים האחרונות מתעצמים הויכוחים בין מדריכי הגידול לאנשי ההדברה בנושא ההליותיס. אלה טוענים כי חייבים לשמור על הכפתורים בעמדות הראשונות של הפרי על הצמח, כי תרומתם חשובה ליבול, ולכן צריך לרסס לפי סיפי פעולה נמוכים. אלה טוענים כי הצמח מסוגל לפצות עצמו, וחשוב לא לרסס לפני שמגיעים לסף, כדי לא לפגוע בפעולתם של האויבים הטבעיים. השנה בוצע ניסוי אחד שנועד לבחון ריסוס לפי סף נמוך מול סף מומלץ, ושקילת היבול.
הלקטים סגורים שנשארים על הצמח לאחר הקטיף למעבר מעונה לעונה לכן חשוב להגיע לקטיף עם פחות ככל האפשר הלקטים סגורים ניתן לנסות לבצע זאת ע"י זרוז פתיחתם של ההלקטים הגדולים יותר ונשירתם של הקטנים לפני שהבשילו זרעים.
טיפול בגליפוסט 500 ("מנשיר") וקוויק 300 (מזרז פתיחה) 30 ו-16 ימים לפני הקטיף בכותנה פימה מהזן 008 בשילובים שונים לא השפיע על היבול ולא על מרכיבי האיכות השונים.
הניסוי התבצע בחוות הגד"ש לניסויי שדה של הגליל המערבי . חלקות קטנות (10 שורותX 10 מטר), בניסוי נבחנו שלושה זנים שונים PF-15 . P008 ו- E2. זריעה והנבטה ב-29.3. ההשקיה הדישון והדברת המזיקים ניתנו כפי שמקובל באזור. יושמו שני משטרי טיפול שנבדלו במספר הטיפולים ובמועד הסיום בהשוואה לבקורת לא מטופלת, כל הטיפולים להדברת החלפת ניתנו ב-מנקס 250 ג"ר \ דונם,
כל 10 ימים התבצעה בכל החלקות הערכת נגיעות בחלפת לפי סולם יאיר זקס. בכל הטיפולים התפתחה חלפת מועטה ובזן E2 לא הופיעה כלל. קטיף בקטפת לשקים ללא הבדלים מובהקים ביבול בין הטיפולים בשלושת הזנים.
מרבית ההלקטים הירוקים, שאינם נקטפים, מאוכלסים במידה רבה בזחל ורוד. להתמודדות עם בעיה זו, בחרנו בשתי דרכים –
1. "קיצור עונה" ומניעת היווצרות ההלקטים הירוקים.
2. ריסוס בתכשיר המפחית נוכחותם על הצמח והתפתחותם.
הזחל הורוד (Pectinophora gossypiella), הוא אחד ממזיקי הכותנה הנפוצים והקשים בארץ ובעולם והוא עלול לגרום לנזקים כלכליים כבדים. הנזקים נובעים מיבולים מופחתים, מירידה בטיב הכותן ומעלייה בשימוש בקוטלי-חרקים בלתי בררניים.
הליותיס הוא מזיק רב פונדקאי נפוץ בגדולים רבים. אוכלוסיית ההליותיס מתרבה באביב והולכת ויורדת לקראת יולי – אוגוסט.
ב 17 תחנות ניטור מזיקים הפזורות באיזור בית שאן – גלבוע, מנוטרות אוכלוסיות של ששה מזיקי מפתח לאורך כל השנה, כולל הליותיס